Huit ans après la débâcle d'Ingen, Alan GRANT (Sam NEIL), le célèbre paléontologue peine à trouver les fonds nécessaires pour financer ses recherches sur les dinosaures. Un riche aventurier, Paul KIRBY (William H. MACY) et sa femme, Amanda (Téa LEONI) se disent prêt à financer ses travaux après qu'il les aura accompagné dans leur propre tournée aérienne au dessus du nouveau site d'Ingen : Isla sorna. GRANT flaire une entourloupe sitôt que l'avion ammorce sa descente sur l'île. Lorsqu'un accident survient avec une créature géante, surgie de la forêt, GRANT découvre que le but réel des KIRBY est de tenter de retrouver leurs fils de 14 ans, Eric (Trevor MORGAN), disparu quelques jours plus tôt dans cette jungle peuplée de dinosaures.
Un jeune passionné d'astronomie fait une terrible découverte : une comète titanesque est sur le point d'entrer en collision avec la terre... des images impressionnantes, un scénario-catastrophe qui n'est pas sans rappeler celui d'armaggedon, des effets-spéciaux à couper le souffle et une séquence spatiale très réaliste font de deep impact une formidable réussite de technologie et de suspense ; un film de science-fiction à l'échelle humaine, puisque plausible dans son déroulement. la scène finale, tout simplement hallucinante, atteint des sommets de gigantisme.